Математический факультет является одним из старейших факультетов Национального Университета Узбекистана, был создан как отдел в составе Народного университета Туркестана.
В период 1918-1932 годов в разные годы руководителями физико-математического отдела работали: проф. В.И.Романовский, проф С.Н. Наумов, проф. А.В.Благовешенский, проф. В.Г.Мухин, проф. О.К.Ланге, доцент И.А.Теплов.
В 1932 году на основе физико-математического отдела был создан физико-математический факультет. В должности декана этого факультета работали: доцент Р.Р.Цуммерман (1933-1934), доцент А.П.Доморяд (1934-1935), доцент А.Л.Перельник (1935-1936), проф. В.И.Романовский (1936-1938) проф. А.А.Скворцов (1938-1954), доцент М.М.Султонова (1954-1959).
В 1959 году на основе физико-математического факультета были созданы два факультета: физический и механико-математический. Первым деканом механико-математического факультета была доцент М.М.Султонова. В 1961-1965 годах в долж-ности декана этого факультета был доцент М.А.Сабиров, в 1965-1971 годах доцент М.Вахидов.
В 1971 году на основе механико-математического факультета было создано два факультета: математический и прикладной математики и механики. Деканом математического факультета был избран проф. Дж.Х.Хаджиев, затем деканами работали проф. А.С.Садуллаев (1985-1992), проф. А.Азамов (1992-1993), проф. Г.Худойберганов (1993-1994).
В 1994 году в связи с объединением факультетов математики и прикладной математики и механики факультет стал снова называться механико-математическим. Деканами факультета были: проф.Г.Худойберганов (1994-2001), проф. Р.Р.Ашуров (2001-2003), проф. Б.А.Шоимкулов (2003-2013), доц. Джумабоев Д.Х. (2013-2015), доц. Худойбердиев А.Х. (2015-2017), Н.М.Жабборов (2017-2019), доц. А.Р.Кутлимуратов (2019-2020). С 2020 года факультет возглавляет профессор О.С.Зикиров.
Из выпускников факультета 21 стали академиками: Кори-Ниёзий Т.Н, Уразбоев М.Т, Саримсоков Т.А, Сирожиддинов С.Х, Салохитдинов М.С, Жураев Т.Ж Азларов Т.А, Фармонов Ш.Қ, Сатимов Н.Ю., Ходжиев Ж.Х, Садуллаев А.С., Аюпов Ш.А, Кабулов В.Қ., Рашидов Т.Р., Бондаренко Б.А., Мубораков Й.Н., Буриев Т, Абуталиев Ф.Б., Файзуллаев Ж.Д., Бузин Е.И., Филатов А.Н. А также более 100 из выпускников стали докторами наук и профессорами. Более 50 выпускников факультета успешно работают в разных зарубежных научных центрах и университетах.
В настоящее время будущих специалистов готовят более 120 профессоров-преподавателей. Из них 6 академиков, около 40 докторов наук – профессора, более 50 кандидатов наук –доцентов.