Кафедра микробиологии и биотехнологии была создана в 1938 году академиком И.А. Райковой как кафедра «Подземные растения» Ташкентского государственного университета.

С 1940 года проф. П. Головин руководил и обучал кадры в области микологии.

В 1956 году доцент О.Г.Ёлкина открыла на кафедре кафедру микробиологии, на которой готовили кадры: К.Ю.Мусаев, Ф.Г.Ахмедова, Я.Ф.Низаметдинова, М.Л.Мансурова, А.М.Музафаров, Е.В.Кондратьева, Ш.А. Тожибоев, К.И. Ибодов.

С 1990 года кафедру микробиологии возглавляет проф. Руководил А.Х.Вахабов.

В 1989 году проф. М.М. Рахимовым создана кафедра биотехнологии и ведется подготовка кадров по этому направлению.

В 2005 году кафедры микробиологии и биотехнологии были объединены и заведующим кафедрой стал проф. Был назначен М.М. Рахимов.

За 70 лет кафедры микробиологии и биотехнологии были созданы не только для Узбекистана, но и для Таджикистана, Кыргызстана, Туркменистана, Казахстана, а также Российской Федерации, Китая, Норвегии, Кореи, Египта, Ирака, Кубы, Германии и др. США подготовили высококвалифицированные кадры в области микробиологии и биотехнологии. Профессора и преподаватели кафедры микробиологии и биотехнологии направляются в престижные университеты ряда зарубежных стран для повышения квалификации.

Крупные ученые, доктора наук, профессора, академики, развивающие область микробиологии и биотехнологии в Узбекистане и за рубежом, являются бывшими студентами кафедры микробиологии и биотехнологии. Среди выпускников кафедры «Микробиология и биотехнология» — государственные и общественные деятели, депутаты Олий Мажлиса, руководители научных учреждений нашей страны, крупные учёные. Министр инновационного развития Республики Узбекистан И.Ю. Абдурахманов и его заместитель Ш.У. Турдигулова, ректор Университета Аджу в г. Ташкенте Г.А. Муратовы также являются выпускниками кафедры. Кроме того, выпускники кафедры в настоящее время работают в университетах Калифорнии и Нью-Йорка, Российском аграрном университете, педагогических институтах Республики Казахстан.

На кафедре студентам бакалавриата преподаются такие общие предметы, как наземные растения, микробиология и вирусология, биотехнология и медицинская микробиология.

Кафедра имеет степени магистра в области микробиологии и вирусологии и биотехнологии.

Магистрантам в области микробиологии и вирусологии преподаются предметы молекулярной микробиологии, промышленной микробиологии, молекулярной биологии вирусов, биологии грибов, систематики и цитологии микроорганизмов, микробиологии почвы, прикладной микологии и вирусных болезней растений.

Преподаются специальности «Биотехнология» «Молекулярная биотехнология», «Прикладная энзимология», «Биотехнология биологически активных и лекарственных веществ», «Основы биологической специфичности», «Биотехнология и экологические проблемы», «Иммунобиотехнология», «Нанобиотехнология», «Аффинная хроматография».

Сегодня кафедра микробиологии и биотехнологии сотрудничает с Институтом микробиологии Академии наук Республики Узбекистан, Институтом биохимии и биофизики, Институтом химии растений, Институтом генетики и экспериментальной биологии растений.

В настоящее время талантливые ученые-исследователи научных школ, создавших Вахабова Абдурасула Хакимовича и Мирзаачама Мирзахакимовича Рахимова, возглавляют учёных-микробиологов, вирусологов и биотехнологов Узбекистана и передают свои знания и опыт своим ученикам.

С 2021 года на кафедре микробиологии и биотехнологии доктор биологических наук, проф. Заведующая Нормуродова Кундуз Тогаевна. 2019 г. Нормуродова проф. Под руководством Г. А. Муратова успешно защитил диссертацию доктора биологических наук на тему «Совершенствование биотехнологии экстракции этанола из крахмалосодержащего сырья». В результате научных исследований К.Т.Нормуродовой опубликовано более 75 научных работ, в том числе 45 научных статей в престижных журналах республики, опубликовано более 30 тезисов и статей на международных и республиканских научных конференциях.