Кафедра теоретической физики была основана в 1935 году. В 1935-1941 годах кафедрой руководил проф. А.Е.Левашов, академик 1941-1957 гг. С.У.Умаров, 1957-1965 гг. проф. ГМ Авакянц, 1965-1967 проф. А. Тешабоев, 1967-1972 гг. проф. Р. Х. Маллин, 1972-2005 гг. академик. Директором был М.М.Мусаханов. С 2005 по 2016 год кафедра теоретической физики была объединена с кафедрой ядерной физики и создана кафедра ядерной и теоретической физики. В 2016 году кафедра теоретической физики была выделена в отдельную кафедру, а с мая 2017 года акад. Ведущий М.М. Мусаханов.
С приходом на кафедру М.М. Мусаханова среди проводимых здесь научных исследований по физике полупроводников начались научные исследования по таким новым направлениям, как физика высоких энергий, столкновение атомов и ядер, взаимодействие излучения с окружающей средой. Установление научных связей с крупными научными центрами, имеющими большой потенциал: Объединенным институтом ядерных исследований (ЯТБИ, Россия, Дубна), Институтом физики имени Лебедева (РФА ФИ, Москва) создало основу для активных исследований. По инициативе М.М. Мусаханова в учебный процесс были введены новые специальные курсы для теоретиков, такие как квантовая хромодинамика, теория элементарных частиц, теория калиброванных полей. Тесные связи с ЯТБИ дали студентам и выпускникам кафедры возможность посещать крупную научную школу в Дубне. Для чтения лекций на кафедру были приглашены ведущие теоретики. В результате спрос на выпускников кафедры возрос в научных центрах мира, популярность кафедры распространилась не только на Узбекистан, но и на Грузию.
Новая эра кафедры теоретической физики началась после обретения независимости Республики Узбекистан. Область научных исследований кафедры включает физику элементарных частиц и квантовую теорию поля (М.М.Мусаханов, Б.А.Файзуллаев, У.Яхшиев, А.Каримходжаев), теоретическую ядерную физику (Б.Ф.Иргазиев), взаимодействие излучения с веществом (П.Э.Пяк), нелинейная включает теорию волновых процессов (А.А.Абдумаликов, А.С.Рахматов, Х.Н.Исматуллаев), теорию физики конденсированных состояний (М.М.Мусаханов, Б.Абдуллаев).
В плане подготовки кадров на физическом факультете особое место занимает область теоретической физики. Творческий коллектив кафедры под руководством профессора А.А. Абдумаликова в 2008-2011 годах создал четырехтомник на узбекском языке по курсу теоретической физики (Б.А. Файзуллаев «Теоретическая механика», А.А. Абдумаликов «Электродинамика», М.М. Мусаханов, А.С. Рахматов «Квантовая механика», А.А. Абдумаликов). , Маматкулов Р. Вышел в свет учебник «Термодинамика и статистическая физика». В 2014 году изданы учебники «Методы математической физики» (Б.А.Файзуллаев, А.С.Рахматов) и «Математические методы теоретической физики» (Б.А.Файзуллаев) для магистров. Кафедра гордится своими высококвалифицированными профессорами и преподавателями.
Современный процесс университетского образования невозможно представить без компонентов ИКТ. Именно усилия, направленные на создание этих компонентов, научно-технических решений, методологии создания современной электронной учебной литературы и создания электронной оболочки, а также деятельность профессоров и преподавателей и студентов в электронной среде нашли свое отражение в обширных исследованиях. педагогическая деятельность сотрудников кафедры (А.Каримходжаев). Не секрет, что процесс информатизации принципиально отличается от процесса компьютеризации, а потому это процесс, требующий больших денежных затрат. В связи с этим под руководством доцента А.Каримходжаева созданы компьютерные сети не только в УзМУ, но и в Студенческом кампусе и Докторском кампусе, с использованием 12 грантов международных доноров (всего: 825 000 евро и 240 000 долларов США). ), включая гранты TEMPUS (Европейский Союз), ЮНЕСКО.
Запущен Открытый образовательно-информационный центр, располагающий 120 компьютерами и оснащенный современными серверами (А.Каримходжаев, А.С.Рахматов), создан и действует факультет ЮНЕСКО по астрономии и физике (М.М.Мусаханов, А.С.Рахматов).